Genomics UA
952 subscribers
110 photos
2 files
180 links
Громадська організація "Геноміка ЮА". Ваш дім біоінформатики та омік в Україні.

Чат: https://t.me/BioinformaticsUA
Вебсайт: genomics.org.ua
YouTube: https://www.youtube.com/@genomicsUA
Download Telegram
Почни новий навчальний рік з Genomics UA! 🍁

Ми раді анонсувати new addition курсу "РНК-секвенування: аналіз даних в R". Тепер у співпраці з lifesciencescourse.org* 🤩

Курс надає підготовку з біоінформатичного аналізу експресії генів, зосереджуючись на аналізі РНК-секвенування з використанням R. Курс також знайомить з основними концепціями аналізу РНК-секвенування поодиноких клітин.


Ми пропонуємо:
🎓 курс для студентів, аспірантів та просто зацікавлених
💻 15 занять із поєднанням лекцій і практичних сесій
🤝 зворотний зв'язок та додатковий сертифікат за захист командного проекту
💶 25 стипендій у розмірі 200 євро завдяки фінансуванню DAAD

Не пропусти можливість навчитись найпопулярніших навичок в біоінформатиці 😉

Реєструйся: тут
Дедлайн реєстрації: 23 липня (включно)
Початок: 1 серпня

* Проєкт LifeSciencesCourse підтримує якісне навчання українських студентів біологічних спеціальностей в умовах війни. Він заснований завдяки співпраці інституту фізіології університету м. Тюбінгену (Німеччина), кафедри біохімії та біотехнології Прикарпатського національного університету ім. Василя Стефаника та Німецької служби академічних обмінів (DAAD).

- - -
📩 Чат спільноти Геноміки ЮА | 📹 Youtube-канал | 🌐 Вебсайт | ☁️ genomicsua.bsky.social | 🔗 LinkedIn сторінка
191
Фото: частина учасників спільноти Геноміки ЮА та BioInUA, які взяли участь в Eastern European Bioinformatics and Computational Genomics School.

7-20 липня в Ужгороді відбувається Biological Data Science Summer School, тож запрошуємо ділитися враженнями і фотографіями з обох заходів в чаті.
25
▶️Вакансія від Receptor.AI. Компанія, яка займається drug discovery & персоналізованою медициною, шукає Junior Machine Learning Engineer. Нижче - текст оголошення з каналу Reptiloid Scientist:

Requirements:
- Working knowledge of machine learning and deep learning techniques.
- Strong programming skills in Python.
- Experience with statistical analysis, data mining, and data visualization techniques
- Fluent written English (good spoken English is a plus).
- Understanding of the basics of organic chemistry and molecular biology (university degree in Bioinformatics, Computational Biology, Computational Chemistry, Computer Science, or a related field is a plus).

▶️ Робота full-time і повністю віддалена, без обмежень щодо локації. Відгукнутися можна в телеграм співзасновнику та CSO компанії Семену Єсилевському.

▶️ Дісклеймер: ми не афілійовані з команією і публікуємо цю можливість на безоплатній основі. Але якщо ви дізналися про вакансію з нашого каналу, напишіть про це при спілкуванні з потенційним роботодавцем - нам буде приємно.
- - -
📩 Чат спільноти Геноміки ЮА | 📹 YouTube | 🌐 Вебсайт | ☁️ genomicsua.bsky.social | 🔗 LinkedIn
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM
6🦄2
Genomics UA
Почни новий навчальний рік з Genomics UA! 🍁 Ми раді анонсувати new addition курсу "РНК-секвенування: аналіз даних в R". Тепер у співпраці з lifesciencescourse.org* 🤩 Курс надає підготовку з біоінформатичного аналізу експресії генів, зосереджуючись на…
Ми щойно розіслали листи щодо нашого курсу РНК-секвенування: аналіз даних в R, профінансованого DAAD. Якщо ви реєструвалися на курс - перевіряйте вхідні повідомлення. Всередині:

* інформація для доступу до вашого акаунту та пошти на genomics.org.ua.
* інформація про платформу, де, власне, буде проходити курс та спілкування по ньому, а також де знайти посилання на зустрічі.
* відповіді на (як ми думаємо) типові запитання.

Якщо ви реєструвалися на курс, але не отримали листа - щось пішло не так, або ваша пошта була написана з помилкою при реєстрації. В такому випадку напишіть на opetrenko@genomics.org.ua.

Побачимося 1-го серпня на першому зайнятті!
- - -
📩 Чат спільноти Геноміки ЮА | 📹 YouTube | 🌐 Вебсайт | ☁️ genomicsua.bsky.social | 🔗 LinkedIn
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM
8
▶️ В останні 2 дні вступної кампанії в бакалаврат старий товариш Геноміки ЮА Олексій Болдирєв вривається до вас з нав'язливою (завжди раді - прим. адмінів) рекламою.

Дивіться, є кафедра біотехнології Національного авіаційного університету. Біотехнологія? В авіаційному?

Ви праві. Усе таке, не дуже добре. З іншого боку, з біотехнологією загалом в Україні не дуже добре. Уже й компаній багато є, а викладання гальмує. Розвитку кафедр і викладачів заважає консервативне університетське середовище.

Ми на кафедрі маємо підтримку керівництва університету на те, щоб зробити щось нове. Багато цікавих і корисних курсів — формальних і нормативних, а також вільних та за бажанням. Покличемо класних лекторів з-за кордону. Вліземо у всілякі актуальні теми про вакцини, синтетичні організми, drug discovery та всяке таке. Будемо нещадно різати бюрократичну історію, додавати гнучкості та співпрацювати з прогресивною індустрією.

Це ризикована історія нового, яке ми будемо робити в будь-якому разі. З нами Ольга Маслова, відома популяризаторка науки з глибокими знаннями в галузі клітинних технологій. З нами є або будуть спеціалісти та спеціалістки з різних напрямів біотехнології. Звичайно, ми будемо створювати курси, щоб студенти орієнтувалися (або навіть спеціалізувалися) в біоінформатиці та геноміці. Нас підтримує Київський академічний університет — на основі спільних цінностей науки та людяності.

Отже, як завідувач кафедри, запрошую вас вступати на нашу спеціальність (162, якщо цікаво). Обіцяю, що нудно не буде.


▶️Якщо знаєте абітурієнтів, які розглядають напрям біотехнологій - будемо вдячні за репост та дружню пораду!

- - -
📩 Чат спільноти Геноміки ЮА | 📹 YouTube | 🌐 Вебсайт | ☁️ genomicsua.bsky.social | 🔗 LinkedIn
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM
15
▶️ Публікуємо запрошення на хакатон від учасниці нашої спільноти, оскільки в нас багато підписників з досвідом в AI:

6-8 вересня у Києві, на локаціях Kooperativ та MacPaw Space, відбудеться AI for Ukraine Recovery Hackathon, організований Civitta та Radar Tech. Це подія, яка об'єднає понад 150 учасників для роботи над інноваційними рішеннями у сферах:

📈 Оцінка збитків
🔗 Кібербезпека
🫂 Ефективність та вплив міжнародної підтримки
🧘 Ментальне здоров'я
⚔️ Боротьба з дезінформацією

Допомагати в розробці рішень будуть експерти з Мінцифри, UA Damage, Українського фонду стартапів та Гуманітарного фонду Сергія Притули, софт-платформи Osavul. Фінансовий приз в розмірі $15,000 та підтримку в челенджі “Ментальне здоров'я” надає Дитячий фонд ООН ЮНІСЕФ та всеукраїнська програма “Ти як”.

Найсильніші команди отримають можливість запітчити свої ідеї перед представниками уряду, бізнесу та волонтерських організацій і позмагатися за призовий фонд у $15,000. Крім того, найкращі проєкти зможуть приєднатися до пре-акселераційної програми.


▶️ Взяти участь можна безкоштовно за умови реєстрації до 2-го вересня. Кількість місць лімітована, тому реєстрація може закінчитися раніше. Організатори забезпечать учасників необхідними матеріалами та харчуванням.

▶️ Будемо вдячні за поширення.

- - -
📩 Чат | 📹 YouTube | 🌐 Вебсайт | ☁️ bsky.social | 🔗 LinkedIn
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM
2
▶️ Геноміка ЮА попросила декількох людей з нашої спільноти поділитися чимось цікавим зі своєї роботи, навчання або просто досвідом, який може бути корисним для інших. Маєте що розповісти про себе? Напишіть сюди: team-genomics@genomics.org.ua і давайте поспілкуємося про публікацію #HumansOfGenomicsUA.
- - -
Bonjour, je m'appelle Valeriia. Пишу записку вам з Шербруку (Квебек, Канада). Тут зима триває пів року і напівфабрикати — звична їжа місцевих. Але також тут крута science.

Якщо ви працюєте в західних інститутах/компаніях, то я вас не здивую. Усі знають про наукові здобутки всіх в установі, всі співпрацюють з усіма, і (особливо в Канаді) всі з усіма привітні.

Університет Шербруку — не найконкурентніший у провінції, але він дійсно піклується про доброустрій. Тут є research facilities від клітинних культур до очищення білків та магазин з усім лабораторним пластиком і не тільки. Студентська стипендія дозволяє не працювати (щоправда, тусити кожної п'ятниці не вийде). Маєш певні результати та хочеш на конференцію? Дуже вірогідно, що твій науковий керівник усе оплатить.

Про культурний шок українського студента в Канаді можна писати ще довго, та давайте про science. Інститут, у якому я працюю (IRCUS), спеціалізується на дослідженні раку. Але насправді тут вивчається багато чого паралельно і це супер допомагає навчатися різноманітних технік і галузей. Навіть у нашій лабі під керівництвом професорки Marie Brunet ми робимо scRNA-seq, протеоміку, геноміку, машинне та глибоке навчання, а ще трохи еволюцію і молекулярку в мокрій лабі.

Ось ще один приклад того, чим тут займаються. OpenProt — це база альтернативних білків, випечена в Шербруку. Що за альтернативні білки? Це всі ті, що відсутні в UniProt, але теоретично можуть експресуватися. OpenProt збирає доказ їх експресії з сотень мас-спектрометричних наборів даних та Ribo-seq. Виявляється, є тисячі білків, які ми ігноруємо, якщо покладаємося тільки на UniProt. Біоінформатика в цьому місці квітне, різноманітність досвіду вітається, тому тут радо приймають іноземних студентів. Основне — показати свої passion and enthusiasm і тоді тобі радо допоможуть у кар'єрі й дадуть гроші.

Те, що важливо в Канаді, в Україні зазвичай не вчать: вміння захоплююче писати та презентувати. Стандарти презентації в Україні: побільше заскладної інформації й тяжкої термінології, все дуже серйозно, текст на пам’ять. Тим часом у Канаді: залишай лише найважливішу інформацію, розповідай як історію, пояснюй ключові терміни як школяру, імпровізуй і жартуй.

Підсумок: хочете знати більше — запросіть на дистанційну каву/пиво — розповім :3

Післяслово: захоплення біоінформатикою було моїм квитком у Канаду. І якнайкраще я змогла це продемонструвати в мотиваційному листі через вклад у спільноту Геноміки ЮА.

🔗 LinkedIn Валерії
- - -
📩 Чат | 📹 YouTube | 🌐 Вебсайт | ☁️ bsky.social | 🔗 LinkedIn
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM
27
▶️ Публікуємо #HumansOfGenomicsUA з учасницею спільноти Анастасією Горловою (🔗 LinkedIn).
- - -
Привіт усім, мене звати Настя. Зараз я живу в Німеччині, але мої друзі жартують, що справжньої Німеччини я не бачила. Чому так? Бо працюю я у великому інтернаціональному інституті, де вітаються люди всіх національностей та підтримується мультикультурність. Інститут цей — EMBL (European Molecular Biology Laboratory) Heidelberg.

У Гайдельберзі знаходиться головна філія інституту, і ще пʼять розташовані у різних містах Європи та Англії. Разом вони забезпечують блискучі умови (матеріальні та нематеріальні) для існування якісної науки. Усі філії надають інструменти та сервіси для:
- структурної біології: electron microscopy and light microscopy facilities;
- мультиоміки: genomics facilities, proteomics facilities, metabolomics facilities, flow cytometry facilities;
- важких компʼютерних обчислень: high performance cluster;
- тощо-тощо-тощо…
Усе обладнання доступне для ваших експериментів. Для співробітників, охочих працювати за інструментом, проводять якісне навчання.

У EMBL знайти собі місце може будь-хто: біологи, хіміки, фізики, інженери та спеціалісти інших галузей. Усе це велике комʼюніті працює над тим, аби відкривати нові горизонти у сферах геноміки, протеоміки, біології розвитку, клітинної та системної біології (Гайдельберг), структурної біології (Гайдельберг, Гамбург, Гренобль), нейробіології та епігенетики (Рим), біології тканини та моделювання захворювань (Барселона), біоінформатики (Гайдельберг, Хінкстон) та в багатьох інших дотичних галузях.

А ще, окрім неймовірної науки, EMBL вирізняється атмосферою та способом взаємодії. Ти будуєш дружні стосунки не лише зі своїми однолітками, а й зі старшими колегами, також можеш вільно спілкуватися з очільником будь-якої лаби й не відчувати барʼєру та напруження стосовно “статусу” співрозмовника.

Оскільки я базуюсь в Гайдельберзі, то можу розказати трохи більше саме про це місце. EMBL тут — це величезний модерний кампус на схилі, оточений зеленим лісом, тут найкраща їжа в їдальні (я не збрешу, якщо скажу, що на рівні хорошого ресторану), приємні лаунж-зони для співробітників, періодичні вечірки, а також безкоштовне пиво з піцою щопʼятниці для заохочення нетворкінгу ;)
Одна з тих речей, що подобаються мені найбільше стосовно EMBL у Гайдельберзі — це ATC (Advanced Training Center), де щорічно проводиться купа конференцій. Якщо ти знаходишся в кампусі на час проведення чергової крутої події, можна прийти і послухати провідних науковців світу, а після їх виступу побалакати з ними за кавою.

Потрапити в це середовище можна на стажування, PhD, Postdoc або на будь-яку іншу відкриту позицію. Стажування можливе завдяки написанню листів очільникам лабораторій, які вас цікавлять. Багатьом з них потрібні люди для численних проєктів. Багато з них мають фінансування, тож за стажування можуть платити гроші. Часто це зарплата, яка відповідає прожитковому мінімуму. Онлайн стажування також можливі, особливо, якщо ви займаєтеся біоінформатикою. Щодо PhD, то в EMBL існує ціла програма для щорічного рекрутингу студентів — EIPP. Дуже рекомендую її спробувати, якщо PhD — це те, що вас цікавить. Отож не соромтеся написати email у лабу вашої мрії — імовірність туди потрапити існує завжди ;)

Я була б рада вітати в EMBL більше гостей з України, і було би класно, якби наше представництво тут росло та зміцнювалося. Про всі-всі плюшки EMBL у малому повідомленні не розповіси, тож залюбки відповім на ваші додаткові запитання ;)

- - -
▶️ Нам цікаво дізнатися чим живе наша спільнота. Є чим поділитися про себе, що могло б допомогти або надихнути інших на їх кар'єрному шляху? Напишіть сюди: team-genomics@genomics.org.ua і давайте поспілкуємося про публікацію.

- - -
📩 Чат | 📹 YouTube | 🌐 Вебсайт | ☁️ bsky.social | 🔗 LinkedIn
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM
21
▶️Залишається ще декілька днів для реєстрації на конференцію BioGENext і ми пропонуємо скористатися цією можливістю. Деякі учасники нашої спільноти є серед запрошених спікерів та будуть презентувати свої роботи.

▶️Відбудеться подія 17-20 вересня і можна приєднатися як онлайн, так і відвідавши захід в Києві. Очікуємо на цікавий нетворкінг!

▶️У програму включені секції з біоінформатики, воркшопи та багато актуальних біомедичних напрямів.

▶️Реєстрація: безкоштовна до 15 вересня за посиланням https://event.fourwaves.com/biogenext. Програма події також там.

- - -
Дісклеймер: ми не афілійовані з організаторами й публікуємо цю можливість на безоплатній основі.
- - -
📩 Чат | 📹 YouTube | 🌐 Вебсайт | ☁️ bsky.social | 🔗 LinkedIn
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM
4💊1
▶️ Київська спільнота Геноміки ЮА, що робите цієї суботи? Ваша колега розповідає про завтрашню подію:
Життя - то гра молекул між собою. Як можна спостерігати цю дивовижну гру, коли ми нездатні побачити гравців? Вам допоможе структурна біоінформатика. Передбачаємо міжмолекулярні взаємодії і боремось із бур'янами... і астмою.
Лектор: Олексій Нипорко, к.б.н., доцент, завідувач кафедри молекулярної біотехнології та біоінформатики навчально-наукового інституту високих технологій Київського національного університету імені Тараса Шевченка.

▶️ 📆 Дата: 14 вересня 2024 р., 16.00

▶️ Місце: MODI Art&Wine Gallery (Київ, Мала Житомирська 17) або онлайн. Трансляція на фейсбук-сторінці Дійсної науки, а запис потім з'явиться на їх ютуб-каналі.

▶️ 📝 Реєстрація: https://forms.gle/okfbaFRzBkgfzN3b7 від 300 грн. З них 150 грн на депозит закладу (можна замовляти напої в закладі за ці кошти) і 150 грн благодійний внесок на основи та матеріали для плетіння маскувальних сіток проєкту "GeliosCat". Але ви завжди можете внести і більшу суму, якщо хочете задонатити більше! Якщо приєднуєтеся онлайн то участь коштує довільну суму донату.

▶️ Посилання для оплати:
https://send.monobank.ua/jar/3wziEwuLow
або картка ПриватБанк 5457082503055845 (скопіювати на Android-смартфонах: 5457082503055845)
- - -
Дисклеймер: ми не афілійовані з організаторами й публікуємо цю можливість на безоплатній основі.
- - -
📩 Чат | 📹 YouTube | 🌐 Вебсайт | ☁️ bsky.social | 🔗 LinkedIn
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM
22🤯2
▶️ Biology outside the box: учасниця нашої спільноти разом з колегами організовує конференцію про цікаву та неординарну науку. Буде проходити в гібридному форматі: можна приєднатися оффлайн в EBML в Хайдельберзі або онлайн.

▶️ 📆 Крайдата реєстрації: 18 жовтня якщо приїдете в EMBL або 29 листопада якщо онлайн.

▶️ Реєстрація та деталі тут: https://phdsymposium.embl-community.io/main/

▶️ Сторінки конференції в соціальних мережах: X (twitter) | Instagram | LinkedIn

Будемо вдячні за розповсюдження!

UPD: реєстрація тез продовжена до 25 вересня.

- - -
Дисклеймер: ми не афілійовані з організаторами й публікуємо цю можливість на безоплатній основі.
- - -
📩 Чат | 📹 YouTube | 🌐 Вебсайт | ☁️ bsky.social | 🔗 LinkedIn
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM
5
▶️ Наш курс "РНК-секвенування: аналіз даних в R" вже на фінальній стадії: залишилися лише дві зустрічі, під час яких учасники будуть презентувати свої курсові проєкти.

▶️ Ми запрошуємо охочих з нашої спільноти приєднатися і підтримати їх на прямій трансляції. Це буде корисно для того, щоб подивитися на "real-life" аналіз транскриптомних даних, такий ж, який біоінформатики роблять в академії й в компаніях. Також заохочуємо ставити питання через чат на YouTube: будемо модерувати, тож зможемо передати їх доповідачам.

▶️ Зустріч 2024-09-16 (сьогодні), 19:00 - 21:00 (час за Києвом):
https://youtu.be/R9ObRnIOKt4

▶️ Зустріч 2024-09-23, 19:00 - 21:00 (час за Києвом):
https://youtube.com/live/r8FwZF5rLS8?feature=share

- - -
📩 Чат | 📹 YouTube | 🌐 Вебсайт | ☁️ bsky.social | 🔗 LinkedIn
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM
6
▶️Харків, є вмотивовані кандидати в аспірантуру?

▶️В ННЦ "Інститут експериментальної та клінічної ветеринарної медицини", у відділ Дениса Васильовича Музики, шукають аспірант:ку в лабораторію молекулярної діагностики. Напрямки роботи: біотехнологія, розробка вет ПЛР, епізоотологія. Спеціальність 091 - біологія.

▶️Потрібно мати диплом магістра біології, складений ЄВІ, зацікавленість.

▶️Писати з цього приводу можна учасниці нашої спільноти Оксані Зленко (телеграм, oksana.ceratium@gmail.com) або одразу завідуючій лабораторії / керівниці аспірантури Поліні Сергіївні Юрко (yurkopolina81@gmail.com).

- - -
Дисклеймер: ми не афілійовані з організаторами й публікуємо цю можливість на безоплатній основі.
- - -
📩 Чат | 📹 YouTube | 🌐 Вебсайт | ☁️ bsky.social | 🔗 LinkedIn
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM
3
Частина учасників спільноти Геноміки ЮА на конференції BioGENext в Києві.

Приходьте послухати доповіді учасників й подивитися постери цими днями 🙂

Фото: Soniia Hatych
- - -
📩 Чат | 📹 YouTube | 🌐 Вебсайт | ☁️ bsky.social | 🔗 LinkedIn
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM
17
🚨BREAKING!🚨
"РНБО прийняла рішення щодо заборони встановлення та використання Telegram на службових пристроях працівників органів державної влади, працівників сектору безпеки і оборони, учасників громадської організації «Геноміка ЮА»...."

Ну що ж робити, РНБО заборонила, тож виконуємо...

Ми починаємо поступову транзицію спільноти Геноміка ЮА з Телеграму до Google Workspace.

Чому?
☕️З початку повномасштабного вторгнення Геноміка ЮА планувала переїхати на іншу платформу. Ми взяли участь у програмі Google for NGO та отримали безлімітний доступ до Google Workspace для нашої спільноти. Тепер усе готово й ми хочемо запросити тебе до нас на біоінформатичну каву.

🗨Genomics UA Workspace дає такі бонуси: схожі на Slack та зручні в користуванні чати, які дозволяють підключати застосунки; 20Gb диску (з можливістю значного розширення на запит для наукових проєктів) і пошта Gmail на домені genomics.org.ua для особистого або професійного користування.

🕺💃Genomics UA Workspace буде ідеальною платформою для колаборації між біоінформатиками України, адже там легко запланувати онлайн-зустріч або створити подію з учасниками спільноти в календарі.

🔥Genomics UA Workspace показав свій потужний потенціал під час нещодавнього курсу "РНК секвенування: аналіз даних в R". Ми вже запровадили one-click access з єдиним акаунтом на вебсайт та систему Moodle, а в подальшому він буде використовуватися і для доступу до наших обчислювальних ресурсів. Надалі всі події будемо хостити там.

🔫Телеграм є зручною, але сумнівною соцмережею. Останнім часом до нашого чату доєднується багато анонімів, а це точно не сприяє тісній взаємодії. Рішення РНБО (а також те, що грантовим агенціям потрібно знати, скільки ми маємо реальних студентів/учених у спільноті) для нас є знаком діяти😼.

Так що, ти з нами?

Аби отримати свій акаунт на Genomics UA Workspace, заповни форму. Вона має на меті деанонімізувати спільноту, тому в ній ми просимо тебе трохи про себе розповісти (звісно, в межах ЗУ "Про захист персональних даних" та GDPR😉)

Цей канал і чат залишатимуться активними. А втім, рекомендуємо доєднатися до нас на Workspace зараз, аби не губити важливу інформацію.
P.S. До того ж, усі наші освітні проєкти тепер будуть саме там.

- - -
📩 Чат | 📹 YouTube | 🌐 Вебсайт | ☁️ bsky.social | 🔗 LinkedIn
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM
75🦄3💊3🤯1🏆1